東京の一隅で発生した誘拐事件。
それは、これから起きる惨劇のはじまりに過ぎなかった…。

灰色都市は大きく4部に分けられた物語で構成されている。
事件の発端となった誘拐事件を追いながら、
その周辺で発生する殺人事件の謎を解いていくストーリー。
プレイヤーの進め方によってエンディングが変化し、全55通りのエンディングが存在する。
アナタはたった一つの真実に辿り着くことができるか？